血液系统病原纳米孔靶向基因检测

血液系统病原纳米孔靶向基因检测

① 背景

感染性疾病的发病率和死亡率均位居全球前十位,唯有从临床样本中准确检测出病原体方可制定最精准的治疗策略。由于病原微生物种类繁多,临床传统方法通量低,耗时长,仍有约50%感染患者正面临病原诊断困难。该项目通过对样本中所有核酸进行测序,从而实现广泛无偏的病原微生物检测。

 

② 技术

采用ONT 平台四代高通量测序技术-纳米孔单分子测序技术,通过纳米孔高通量测序技术结合靶向扩增细菌、真菌、分枝杆菌、特殊病原体(非典型病原体)、病毒等病原微生物的特异性基因区域和技术本身长读长、实时数据输出等优势,可精准鉴定至种或更细分支种属,有助于准确、高效地检测临床样本中的多种微生物,报告提供样本中可检出的所有具有有效数据的微生物,通过报告解读协助临床医师进行分析判断当前感染情况。

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③ 内容

检测项目名称

检测范围

MTseq广谱病原检测

支持细菌17000多种(特殊病原体268种);真菌8900多种;病毒60种,共计两万多种病原微生物检测

TBseek-分枝杆菌及其耐药基因检测

支持检测结核分枝杆菌复合群、40种非结核分枝杆菌、4种结核一线药物相关的6个耐药基因、11种结核二线药物相关的13个耐药基因

HIV SEEK-艾滋病毒分型及耐药基因检测

支持一次检测进行HIV-1型和HIV-2 型鉴定,并区分HIV-1的多个亚型和相关耐药基因

 

④ 优势

a. 灵敏度高:通过对病原体核酸的靶向扩增,可检测高人源背景低丰度病原体的特殊样品,比如血液感染样品;可检测低样品量的感染样品,例如眼科感染。

b. 可实现当天且全面的病原诊断,2小时内出预报告,最终报告时长低于16小时。

c. 假阳性率低:长读长测序,不需组装,不受宿主核酸影响,实现精准定位感染病原。

d. 检测范围广:支持DNA、RNA同时检测,可鉴定病毒、真菌、细菌以及特殊病原体等约2万多种病原微生物,从而实现广泛无偏的病原微生物检测。

 

⑤ 检测流程

 

 

⑥ 适用人群

临床不明原因发热或感染的患者

临床辅助病因检查结果为阴性的患者

疑似或确诊为罕见病原体感染的患者

疑似或确诊为混合感染的患者

已知明确病原感染的患者,用于病程监控